Ввиду того что природа вирусов неоднозначна, номенклатура и классификация их довольно затруднительны. Поэтому вопрос о классификации и таксономии вирусов окончательно не решен. При разработке классификаций вирусов за основу брали различные принципы. Так, по виду поражаемых организмов их делят на четыре группы: вирусы животных, насекомых, бактерий и растений; по тропизму к определенным тканям их подразделяют на нейротропные, дермотропные, пневмотропные, пантропные; по механизму передачи инфекции делят на пять основных групп: кишечные, респираторные, трансмиссивные, дермотропные и возбудители инфекций с различными механизмами передачи. При систематизации учитывают также и другие свойства вирусов.
Современная классификация вирусов основана на характеристике основных свойств вибрионов, из которых ведущим являются тип нуклеиновой кислоты и морфология. По этим признакам группируются все вирусы независимо от поражаемых ими хозяев.
Учитывая международную классификацию вирусов, принятую на IX Международном конгрессе по микробиологии, классификацию, принятую Международным комитетом по номенклатуре вирусов и «Доклад для международного комитета по таксономии вирусов. Подкомитет вирусов позвоночных» все вирусы по характеру содержания нуклеиновой кислоты делят на две большие группы— ДНК и РНК-содержащие.
