Для обнаружения вирусов используют прямой, непрямой методы и метод окраски флуорохромом комплемента. Метод иммунофлуоресценции основан на применении флуоресцирующих антител. С этой целью антитела иммунной сыворотки (гаммаглобулины, альбумины) обрабатывают (маркируют, конъюгируют) красителем (флуорохромом). В качестве флуорохрома чаще применяют изотиоцианатфлуоресцеин. Антитела, меченные светящимся красителем, взаимодействуя с антигеном, образуют микропреципитаты, которые при микроскопии в ультрафиолетовом свете флуоресцируют желто-зеленым светом.

При исследовании прямым методом иммунофлуоресценции конъюгированную иммунную сыворотку или гаммаглобулин добавляют непосредственно к антигену. При непрямом методе препарат с антигеном первоначально обрабатывают той же, но не маркированной имветеринарно-санитарный имунной сывороткой, а затем маркированной иммунной сывороткой. Метод окраски флуорохромом комплемента отличается тем, что к антигену предварительно вносят комплемент (свежую сыворотку крови морских свинок), а затем меченные флуорохромом антитела.