При морфологическом изучении у грибов устанавливают вегетативное тело (таллом), которое у большинства грибов состоит из тонких, ветвящихся нитей — гиф, образующие сплетение — мицелий (грибница). Грибы, имеющие такое строение, называют гифомицеты (плесени). Другая группа грибов не образует мицелия — дрожжи, одноклеточные организмы, относящиеся к классу аскомицетов (сумчатые грибы). Гифомицеты делят на высшие (многоклеточные)—микомицеты и низшие (одноклеточные)— фикомицеты. У микомицетов мицелий разделен перегородками (септирован) на множество клеток. У фикомицетов мицелий состоит из гиф, лишенных поперечных перегородок. Такой мицелий имеет вид сильно разветвленной гигантской клетки, содержащей множество ядер. Гифы разрастаются внутрь субстрата «ли на его поверхности. У некоторых грибов гифы разрастаются, сплетаются и образуют ризоморфы, или склероции, через которые проходят питательные вещества. Молодой мицелий обычно белый, с возрастом приобретает ту или иную окраску. Для прикрепления к субстрату и потребления из него питательных веществ мицелий иногда образует резоиды — корешкообразные выросты.

Дрожжи представляют крупные клетки с двухконтурной оболочкой, шаровидной, овальной или палочковидной формы. Цитоплазма гомогенна, иногда мелкозерниста, содержит дифференцированное ядро, включения (гликоген, волютнн, жир) и вакуоли, а также нитчатые тельца — ходриосомы.