При заражении овец восточными штаммами характерен паралитический синдром (резкая адинамия на протяжении всего заболевания, скованность, паретическая походка, парезы и параличи), изредка наблюдались приступы судорог и гиперкинезы с плавательными движениями или движениями типа «бега на месте». У отдельных животных встречались элементы «манежных движений», которые, однако, совершались по кругу большого радиуса и не были идентичны «вертячке». Гибель животных, зараженных штаммами восточного КЭ, часто наступала в состоянии прострации, комы.

При заражении овец штаммами ШЭ наблюдались приступы «вертячки» и так называемых «манежных движений», мозжечковые симптомы (шаткость при ходьбе и стоянии, тремор, нистагм).

Клиника экспериментального ШЭ, вызванного штаммами И-40 и S-1, отличалась исключительной тяжестью, была чрезвычайно характерна и часто включала, помимо «вертячки», судорожный компонент. Гибель животных чаще наступала в состоянии эпилептического статуса.

Особого внимания заслуживает штамм МО вируса ШЭ, который по клиническим и морфологическим тестам являлся как бы переходным от вируса ШЭ к вирусу восточного КЭ.

Овцы пригодны для дифференциации вирусов группы КЭ по клинико-морфологическим тестам. В связи с недостаточно высокой чувствительностью использование овец для контроля и отбора аттенуированных штаммов группы клещевого энцефалита нецелесообразно.