Томская область занимает юго-восточную часть Западно-Сибирской низменности и в основном расположена в зоне тайги. 54% территории области занято лесами. Она имеет 8 геоботанических районов, из них подтаежный назван томским очагом клещевого энцефалита.
Ландшафт очага является переходным от северной болотисто-хвойной тайги к лиственным лесам и степям средней Сибири и представляет собой равнинную, местами слегка пересеченную местность в междуречье Оби и Чулыма.
Растительные формации отличаются пестротой и разнообразием. Общая площадь лесопокрытия 73,7%. Древесные насаждения представлены в основном вторичными березовыми и осиновыми лесами лесостепного типа в сочетании с лугами и местами с гипновыми травянистыми болотами.
От первобытной тайги здесь остались лишь островки кедровиков и сосновых боров. На опушках смешанных и темнохвойных лесов встречаются высокотравные лесные луга. Поляны среди березовых лесов занимают лесные луга среднего увлажнения, а на возвышенных открытых желаниях располагаются суходольные луга. По речным долинам и логам местами встречаются сфагновые и осоково-моховые болота, низинные сырые луга с зарослями кустарниковой и редкой древесной растительности (С. П. Карпов и В. М. Попов, 1958). Состав растительности весьма разнообразен (498 видов).
На территории очага встречается 50 видов (5 отрядов 33 рода) диких млекопитающих, 218 видов (19 отрядов,’ 121 род) птиц, 5 видов (1 род) иксодовых клещей, 65 видов ,(28 родов) гамазовых клещей, 31 вид (14 родов) блох (Н. И. Иголкин, А. Г. Колмакова, Н. М. Столбов, В. М. Гуковская, 1962).