Очень важна организация амбулаторного лечения больных малярией, которое следует начинать в медицинских учреждениях по месту обращения больного. В дальнейшем назначения врача выполняют участковые медицинские сестры или акрихинизаторы путем посещения больных на дому или на работе медицинским персоналом здравпунктов. Медикаменты больной должен принимать в присутствии медицинской сестры.

В школах, детских домах, садах и яслях больных малярией лечит медицинский персонал, обслуживающий данные учреждения.

Госпитализации подлежат больные малярией в остром периоде (в эпидемический период обязательно). Необходимо также госпитализировать больных малярией в общежитиях новостроек, промышленных предприятий, торфяных и лесных предприятий, совхозов, ремесленных училищ и детей, находящихся в летних оздоровительных учреждениях. При поступлении в больницу и при выписке из нее анализ крови больного на малярию обязателен.

При пернициозной малярии (коматозная и другие формы церебральной малярии, тифоподобная, септикоподобная, желтушная, геморрагическая), встречающейся главным образом в жарких и тропических странах, лечение должно быть начато немедленно при первом же серьезном подозрении на малярию (кровь на исследование у больного берут до лечения, но к лечению приступают до получения результатов анализа).

Сначала вводят 0,1 г акрихина внутривенно (2,5 мл 4% стерильного раствора — очень медленно). Можно вводить эту дозу в 20 мл 40% раствора глюкозы. Тотчас же вводят 0,2 г акрихина внутримышечно (5 мл 4% стерильного раствора). Через 6 или 8 часов делают внутримышечную инъекцию еще 0,3 мл акрихина   (т. е. 7,5 мл 4% раствора).

Бигумаль вводят в первый день в повышенной дозе — до 0,8 г в сутки дробными дозами (0,2 г) внутрь с 6 – или 8-часовыми промежутками между приемами.

Цикл лечения продолжают обычно до 7 дней. При невозможности дачи препарата внутрь внутривенно вводят от 0,1 до 0,15 г бигумаля (т. е. 10—15 мл 1% раствора солянокислого бигумаля или 5—7,5 мл 2% раствора уксуснокислой соли бигумаля) медленно, в течение  5 минут. Общая суточная доза бигумаля при внутривенном введении снижается до 0,45 г (т. е. к вводимым внутривенно 0,15 г добавляют еще 0,3 г per os).

Вводить раствор необходимо после легкого подогревания, так как в охлажденном растворе бигумаль выпадает в осадке в виде кристаллов.

Хинин при пернициозной малярии вводят в первый день в дозе 2—2,5 г в два—три приема. Сначала медленно, в течение 3 минут, вводят 0,25 г, т. е. 5 мл 5% раствора в вену Chinini hydrochlorici. Вслед за этим глубоко в подкожную клетчатку вводят 0,5—0,75 г, т. е. 2—3 мл 25% раствора Chinini bihydrochlorici. Остальное количество вводят также подкожно через 8—10 часов.

После стойкого улучшения и возвращения сознания переходят на пероральную терапию.

Высокой эффективностью при злокачественных формах малярии обладает хлорохин при парентеральном его введении. Внутримышечно вводят 10 мл 5% раствора (0,3 г основания) хлорохина дифосфата (хипамин) или 5—7,5 мл стандартного ампульного раствора хлорохина сульфата (нивахин В), содержащего в 1 мл 0,040 г основания. При необходимости через 6 часов инъекцию повторяют.