В настоящее время известно 6 типов вирусов, входящих в группу клещевого энцефалита. Однако дифференциация их очень сложна. В. И. Ильенко и О. А. Цокрозская отметили особенности течения экспериментальной инфекции у обезьян, зараженных вирусами клещевого, двухволнового и шотландского энцефалитов. Е. Н. Левкович и Л. Г. Карпович дифференцируют вирусы клещевого энцефалита в культурах клеток HeLa, Кларк — по реакции перекрестной преципитации в геле.

Нами проведено изучение 39 штаммов вируса из группы клещевого энцефалита в 12 первичных культурах: фибробластах эмбриона человека, куриного эмбриона, свиньи, теленка, морской свинки, овцы; в почке эмбрионов теленка, свиньи; в легких эмбрионов человека, теленка, свиньи, морской свинки. Испытано также 11 перевиваемых линий: HeLa, СОЦ, Детройт-6, КЭП (почка эмбриона кролика), 709 (ангиосаркома человека), 580 (эпителий кожи человека), 630 (мышцы бедра эмбриона человека), СаМа (рак грудной железы человека), СаРа (рак поджелудочной железы человека), CaVe (рак желудка человека), 750 (перевиваемые клетки из спинного мозга эмбриона человека).

При заражении культур тканей использовали три различные питательные среды, общим компонентом которых была телячья сыворотка и раствор Хэнкса. Частными составными частями были: а) среда Паркера № 199; б) гидролизат лактальбумина; в) коровья амниотическая жидкость.