При анатомо-гистологическом исследовании органов выявлены воспалительные изменения в мелких бронхах с гиперплазией эпителия, наличием спазмов, сужением   просвета, иногда до полной закупорки, при отсутствии некрозов.

Общим было также поражение интерстициальной ткани, отек и инфильтрация междольковых и межальвеолирных перегородок; поражение сосудистой системы (лимфо – и гемо-стазы), основного аргирофильного вещества в виде его огрубения и расплавления как в легких, так и в других органах (сердце, печени, селезенке). Указанные изменения являются характерными для поражения дыхательных органов при коклюше. Аналогичные данные были почти постоянными при гистологическом исследовании органов детей, умерших от коклюша.

Общим для приведенных примеров было и отсутствие эффекта от применявшейся в то время терапии — пенициллина и сульфаниламидов, которые малоактивны в отношении микробов Борде—Жангу.

Начиная с 1950 г., когда была получена возможность пользоваться препаратами, активно действующими на коклюшную палочку (стрептомицин, синтомицин, группа тетрациклинов), летальность при коклюше и осложняющих его пневмониях резко снизилась.

Рано начатая и рационально применяющаяся комплексная терапия (в первую очередь антибиотики и оксигенотерапия) наряду с соответствующим режимом оказывает хороший эффект и при тяжелых формах коклюша, с которыми и в настоящее время нередко дети поступают в клинику.