В механизме образования кисты желтого тела много неясного. Обычно киста развивается в персистентном, задерживающемся желтом теле, по-видимому, в силу перерождения и разжижения центрально расположенных клеток желтого тела.
Не исключена возможность образования кисты из недостаточно оформленного сгустка крови желтого тела. Постепенно в желтом теле, в его центральной части, накапливается жидкость, а стенкой кисты служит слой лютеиновых клеток в 15—20 рядов; количество кистозной жидкости в желтом теле может достигать 20—25 мл.
И. Бойтор с соавторами (1972) выделили из стенки кисты семь типов клеток, из них три гонадотропного типа, в том числе FSH, IH, ITH клеток. Содержимое кисты оказывает влияние на функциональное состояние матки и яичников, изменяя морфологическое состояние ее и течение в них обменных процессов. При этом следует отметить, что гистологическая картина эндометрия зависит от гормональной активности кист.
