Вирусам присущи несколько способов поддержания и сохранения биологического вида главным образом в наиболее неблагоприятной для него межэпизоотический период. Вирусы с коротким циклом размножения, вызывающие остро протекающие болезни, требуют для своей циркуляции постоянного наличия восприимчивых организмов, в то время как возбудители хронических и латентных инфекций способны длительно переживать в пораженном организме. Арбовирусы сохраняются в межэпизоотическнй период либо за счет хронического течения инфекции, либо в организме переносчиков, при этом клещевые арбовирусы передаются половым путем горизонтально и трансовариально потомству. Вирус гриппа свиней способен длительное время сохраняться в организме легочных нематод. Целая группа вирусов, поражающих наружные покровы животных, а также энтеровирусы в силу выраженной устойчивости длительное время не теряют инфекционность во внешней среде.
Дополнительным механизмом вирусной персистенции является наличие у ряда зоопатогенных вирусов многочисленных природных вариаций в иммунологическом отношении (плюралитет). Периодическая смена серотипов способствует сохранению биологического вида за счет преодоления иммунологических барьеров.