Строгие меры профилактики, применяемые против опасных острых и хронических инфекционных болезней, уменьшают или полностью исключают опасность их заноса и распространения в комплексах. Серьезной проблемой становится ликвидация болезней, возникновению которых способствуют трудности организации непрерывного производства, соблюдения требований интенсивного хозяйственного использования животных, правильного кормления, создания оптимального и стабильного микроклимата и выполнения других требований зоогигиены.
На первый план выходит так называемая «внутренняя патология» комплексов, проявляющаяся в развитии пневмоний, маститов, метритов, парезов, рождении мертвых плодов или нежизнеспособного потомства, снижении оплодотворяемости. Причиной этих болезней во многих случаях служат патогенные штаммы кишечной палочки, а также вирусы — так называемые «малые вирусные инфекции» (В. Н. Сюрин, 1973), однако фоном для их развития является снижение общей резистентности организма животных. Последнее также значительно влияет на распространение и тяжесть болезней.
Существует мнение о том, что появление различных болезней в промышленном животноводстве создает в совокупности новую концепцию — «стадную патологию». Она исходит из того, что стадо в комплексах состоит из особей одного вида, возраста и продуктивности, в связи: с чем животные проявляют одинаковую чувствительность к одним и тем же возбудителям. При появлении какого-либо патогенного фактора все или большинство животных почти одновременно заражаются и заболевают, т. е. реализация эпизоотической цели я этих условиях происходит уже в новой форме — голомиантным путем (от греческого «голо» — все, «мианто» — заражать).
