Вирусная инфекция в одной клетке или большой клеточной популяции может быть абортивной под влиянием ограничивающих ее развитие условий — антител, интерферона, температуры. При этом нередко формируется вирусоносительство, когда периодически вирус в одной или нескольких клетках освобождается из-под контроля ограничивающих условий, происходит его нормальное размножение с выходом потомства и тем самым поддержание инфекции. Другим вариантом абортивной инфекции может явиться длительное состояние устойчивого равновесия между неполным размножением вируса и жизнедеятельностью клеток без видимого вреда для последних. Абортивная инфекция на клеточном уровне обоих типов характерна для хронического и латентного течения вирусных болезней.

При онкогенной вирусной инфекции вирусы за счет интеграции своего генома в хромосомы клетки сообщают ей способность к неконтролируемому росту, а иногда вызывают трансформацию, которая приводит к новообразованиям доброкачественного или злокачественного характера.

Существует еще один тип вирусной инфекции — болезни иммунных комплексов. При лимфоцитарном хориоменингите, инфекционной анемии лошадей, африканской чуме свиней, хроническом течении классической чумы свиней образуются аутоантитела против собственных тканей, измененных под влиянием вируса. Иммунные комплексы антигенаутоантитело не перевариваются макрофагами, а оседают в мелких сосудах, особенно почечных, являясь с участием комплемента центром воспаления и вызывая тяжелые поражения, в частности, гломерулонефриты. Вирусы могут аллергизировать организм по типу гиперчувствительности замедленного типа. Подобные аутоиммунные состояния обычно сопровождаются тяжелейшими патологическими явлениями и заканчиваются гибелью животных.