Организм обладает целым комплексом факторов, обеспечивающих его защиту от патогенных агентов до «включения» иммунного ответа. Наиболее важными представляются следующие факторы и механизмы, которые в соответствии с уровнем их защитного от вирусной инфекции действия делятся на три группы.
К первой группе относятся защитные барьеры поверхностей и слизистых оболочек организма. Это прежде всего анатомо-физиологические особенности кожи, респираторного и желудочно-кишечного трактов, а также конъюнктивы животных; повсеместное обильное слизистое покрытие; наличие лизоцима и других ингибиторов вирусной инфекции в слюне, слезах и слизи. Вторая группа включает неспецифические гуморальные факторы и механизмы защиты: различного рода сывороточные ингибиторы, нормальные антитела, комплемент, пропердин и т. п., а также механизмы фагоцитарной реакции и другие естественные способы очищения циркулирующих систем организма.
Третья группа объединяет факторы, которые создают неблагоприятные, ограничивающие для развития вируса условия и губительно действуют на вирусные частицы. Это развитие патологического процесса: образование на месте первичной вирусной инфекции воспаления с местной гипертермией, изменением рН среды в кислую сторону, гипоксией и индукцией интерферона к общая лихорадочная реакция организма.