Живые вакцины, как правило, лучше предохраняют организм от заболеваний, вызываемых вирусами, не имеющими антигенных вариаций, обусловливающими системные патологические процессы с вирусемией и глубокими поражениями органов, при которых постинфекционный иммунитет очень продолжительный (например, профилактические препараты против чумы крупного рогатого скота и плотоядных, классической чумы свиней, болезни Ньюкасла).

Инактивированные вакцины создают удовлетворительную защиту от вирусных болезней, характеризующихся поражением поверхностных тканей (как при «локальных», так и генерализованных инфекциях), с непродолжительным постинфекционным иммунитетом и множественностью иммунологических типов возбудителя (например, инактивированные препараты против ящура и гриппа птиц).

При некоторых вирусных болезнях (например, при арбовирусных инфекциях) оправдано применение тех и других вакцинных препаратов, поскольку в патогенезе болезней большую роль играют циркулирующие системы организма, одинаково хорошо защищаемые при иммунизации живыми и инактивированными вакцинами. Выбор профилактического средства во многом определяется также и эпизоотической ситуацией хозяйства.